医生主要根据流行病学史、临床表现、实验室检查、影像学检查、病原学检查等，综合进行诊断。发病前14天内有武汉市及周边地区，或其他有病例报告社区的旅行史或居住史；发病前14天内曾接触过来自武汉市及周边地区，或来自有病例报告社区的发热或有呼吸道症状的患者；聚集性发病；与新型冠状病毒肺炎患者有接触史。所谓聚集性发病就是指2周内在小范围如家庭、办公室、学校班级等场所，出现2例及以上发热和/或呼吸道症状的病例。实验室检查：早期白细胞总数正常或减低，淋巴细胞计数正常或减少。部分患者出现肝酶、肌酶和肌红蛋白增高。多数患者C反应蛋白和红细胞沉降率升高，降钙素原正常。严重者D-二聚体和炎症因子（白细胞介素-6等）升高。SARS-CoV-2特异性IgM抗体和IgG阳性或SARS-CoV-2的IgG抗体由阴性转为阳性或恢复期较急性期4倍及以上升高也可确诊。影像学检查：早期呈现多发性小斑片影及间质改变，以肺外带明显。进而发展为双肺多发磨玻璃影、浸润影，严重者可出现肺实变，胸腔积液少见。病原学检查：采集患者下呼吸道标本（痰或气道抽取物）可以使得检查更加准确，采用逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction, RT-PCR)或/和高通量测序技术(High-throughput sequencing，HGS)进行核酸检测可以检测出是否感染SARS-CoV-2。