沙眼的治疗包括全身和眼局部药物治疗及手术治疗眼部并发症。药物治疗沙眼衣原体对四环素族、大环内酯类及氟喹诺类抗菌药物敏感。局部可滴用0.1%利福平或沙星类滴眼液，晚上用四环素软膏或红霉素软膏。急性期或严重的沙眼应全身应用抗生素治疗，可口服多西环素或红霉素。手术治疗用于眼部并发症，如严重的睑内翻倒睫、性病性淋巴肉芽肿引起的化脓性淋巴结炎、象皮肿等。