前庭大腺囊肿系由于前庭大腺管开口部阻塞，分泌物积聚下腺腔而形成。阻塞的原因有：感染：前庭大腺脓肿消退后，脓液吸收，腺腔内黏液浓稠而阻塞腺管。管腔狭窄或闭锁：先天性腺管狭窄或闭锁，致使腺腔内液体排出不畅或不能排出，导致囊肿形成。前庭大腺管损伤：个别病例可能由于分娩时，阴道、会阴外侧部裂伤和会阴侧切时损伤腺管或会阴侧切口愈合后发生较严重的瘢痕组织收缩导致前庭大腺管口阻塞形成囊肿。