多数患儿出生时无症状，而于2～3周后逐渐出现症状。早期先天性梅毒多见于早产儿、低出生体重儿或小于胎龄儿；生后的发育、营养状况落后于同胎龄儿。常见症状如下。皮肤黏膜损害发生率为15％～60％，鼻炎为早期特征，于生后1周出现，可持续3个月之久，表现为鼻塞，分泌物早期清，继之呈脓性、血性，含大量病原体，极具传染性，当鼻黏膜溃疡累及鼻软骨时形成“鞍鼻”，累及喉部引起声嘶。皮疹常于生后2～3周出现，初为粉红、红色多形性斑丘疹，以后变为棕褐色，并有细小脱屑，掌、跖部还可见梅毒性天疱疮。其分布比形态更具特征性，最常见于口周、鼻翼和肛周，皮损数月后呈放射状皲裂。骨损害约占80％～90％，但多数无临床体征，少数可因剧痛而致“假瘫”。主要为长骨多发性、对称性损害，X线表现为骨、软骨骨膜炎改变。全身淋巴结肿大见于50％的患儿，无触痛，滑车上淋巴结肿大有诊断价值。肝脾大几乎所有患儿均有肝大，其中1/3伴有梅毒性肝炎，出现黄疸、肝功能受损，可持续数月至半年之久。血液系统损害表现为贫血、白细胞减少或增多、血小板减少及库姆斯试验阴性的溶血性贫血。中枢神经系统症状在新生儿期罕见，多在生后3～6个月时出现急性化脓性脑膜炎症状，脑脊液中淋巴细胞数增高，蛋白呈中度增高，糖正常。其他肺炎、肾炎、脉络膜视网膜炎、心肌炎等。晚期先天性梅毒症状出现在2岁后，主要包括楔状齿、马鞍鼻、角膜炎、神经性耳聋、智力发育迟缓等。