确诊小儿疱疹性咽峡炎主要依靠咽部检查、血常规、血清学检查、C反应蛋白检测。咽部检查观察咽部有无充血、疱疹等情况。血常规提示机体有无感染。血清学检查明确病原体，为诊断提供依据。C反应蛋白检测有助于鉴别合并细菌感染。