引起太田痣的病因不是十分清楚，可能与以下因素有关：可能与遗传有关，可能在胚胎发育期间，黑素细胞由神经嵴向表皮移行时发生障碍而滞留在真皮内，从而引起太田痣。主要的诱因有外伤、局部炎症等。部分患者的真皮黑素细胞中存在雌激素、孕激素、雄激素受体，与青春期太田痣的发生和加重有关。