最常用的根治方法是局麻下手术切除，继发感染需应用抗菌药物，有脓肿形成者，需切开引流。手术治疗皮脂腺囊肿是体表小肿物，手术简单，在门诊即可进行。其他治疗CO2激光、电离子微创法被认为是治疗无合并感染的囊肿的好方法，由于其操作简单，切口小，出血少，不用缝合，几乎不留瘢痕，复发率低，尤其适合于颜面部皮脂腺囊肿的治疗。