不同原因引起的脑器质性精神障碍，治疗原则不同。颅脑外伤所致精神障碍急性期以颅脑外伤的专科处理为主，并给予卧床休息和对症处理。对兴奋躁动并确诊为非颅内出血所致者，在密切观察瞳孔与意识状态情况下，予以小剂量抗精神病药或抗焦虑药。后期精神障碍脑外伤后综合征与神经症采用相应神经症的治疗。脑肿瘤所致精神障碍病因治疗以手术治疗为主。对症治疗有颅内压增高表现者，给与脱水降颅压治疗。药物治疗无意识障碍但出现精神兴奋状态时，可适当采用安定剂，如硝基安定。慎用抗精神病药物。脑血管病所致精神障碍积极控制导致脑血管疾病的危险因素。改善精神症状脑衰弱综合征可采用神经衰弱的治疗。对兴奋躁动、幻觉、妄想常选用抗精神药物治疗，严重兴奋躁动者可予以安定或氟哌啶醇，抑郁明显时首选三环类抗抑郁药。意识障碍时应给与促神经细胞代谢药。痴呆者可用改善脑代谢药物。癫痫性精神障碍调整抗癫痫药的种类或剂量，以防止癫痫发作前后的精神障碍。散发性脑炎所致精神障碍病因治疗。促进意识恢复：精神症状突出时可用小剂量抗精神病药作短期对症治疗。对症治疗和支持治疗。