本病需要与急性膀胱炎，腺性膀胱炎，膀胱结核等疾病进行鉴别。如果女性出现持续性进行性尿频，尿急，夜尿增多，耻骨上疼痛等症状，经抗生素治疗无效者，应考虑到间质性膀胱炎的可能。通过体格检查、实验室化验，影像学检查，尿道膀胱镜检查和尿流动力学检查等进行诊断和鉴别诊断。