主要的治疗方法是外科手术和介入治疗，药物只能缓解一些症状，不能治愈先心病。外科手术根治手术：根据病情程度在婴儿期或学龄前施行。姑息手术：不能耐受根治手术的婴儿或儿童，可先行姑息手术，为以后完全矫治创造条件。心脏移植手术：主要是先心病晚期患者考虑心肺联合移植术或肺移植联合心脏矫治术。介入治疗经皮球囊扩张术：应用扩张法解除血管及瓣膜的狭窄，如主动脉狭窄、肺动脉狭窄等。经导管封堵术：利用特制封堵器堵闭不应有的缺损，如房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭等。其他介入治疗：经皮球囊动脉扩张及支架或人工瓣膜植入术。