确诊尿道炎主要依靠实验室检查。血常规检查提示外周血白细胞计数及中性粒细胞计数升高，可证实存在炎症反应。尿道分泌物涂片通过在革兰氏染色涂片中观察到大量多形白细胞和单核细胞来证实尿道炎的诊断。病原体检测通过分泌物培养，在淋菌性尿道炎患者的分泌物中找到革兰氏阴性双球菌；在非淋菌性尿道炎患者的分泌物中找到衣原体或支原体的包涵体。通过核酸杂交试验和核酸扩增试验，可在短时间内大量复制病原体DNA，以判明病原体感染情况，有利于疾病的诊断。利用酶联免疫试验（ELISA）检测患者泌尿生殖道标本中的衣原体抗体，敏感性和特异性高。该法操作简便、快速、观察结果客观，是目前临床上用于检测泌尿生殖道沙眼衣原体感染的常用方法。