藏毛囊肿没有继发感染时可无明显症状，出现感染后的主要症状是骶尾部脓肿。主要症状骶尾部脓肿，局部有红、肿、热、痛等急性炎症特点，脓肿可自动穿破流出脓液。反复发作者可形成慢性窦道（窦道是指机体感染后坏死组织经体表排出体外后而形成的一个开口于体表的、不与体内空腔脏器相通的盲管）。常见到有与周围皮肤不相连的毛发从窦口长出。