多数疣患者在发病1～2年内自行消退，不少患者即使采用深度破坏性方法，有1/3疣仍复发，因此需慎重选择，对一些能造成永久性瘢痕的疗法，不宜使用。药物治疗维A酸类药物，要注意有生育意向的人不建议使用。干扰素，对多发性且顽固难治的疣，可配合全身或病损局部注射干扰素，单独使用疗效不肯定。治疗疫苗，目前处于临床试验阶段。局部药物治疗氟尿嘧啶博来霉素0.7%斑蝥素0.1%-0.3%维A酸乙醇溶液0.5%鬼臼毒素5%咪喹莫特霜西多福韦光动力学疗法系统或局部外用光敏剂，光照后引起局部细胞死亡，可治疗部分寻常疣、尖锐湿疣。物理疗法冷冻疗法、电灼疗法、激光治疗、红外凝固治疗适用于数目少的寻常疣和跖疣。手术切除个别巨大疣体可行手术切除术。