手术治疗彻底的手术切除是甲状腺乳头状癌最基本的治疗方法。根据甲状腺肿瘤病变情况选择一侧甲状腺叶加峡部切除或全甲状腺切除，根据颈淋巴结转移情况选择中央区淋巴结清扫或颈淋巴结清扫。不主张行甲状腺肿瘤摘除或甲状腺次全切除。甲状腺激素治疗甲状腺激素治疗可抑制人体生成血清促甲状腺素，而血清促甲状腺素能促进甲状腺癌细胞的生长。因此，甲状腺激素治疗能够去除促进甲状腺癌细胞的生长的环境，达到治疗的目的。放射性核素治疗出现肺部或骨骼转移的晚期病例及某些高危病例应行碘131治疗。放射性核素治疗前需行全甲状腺切除术。