确诊桥本甲状腺炎可能用到体格检查、实验室检查、影像学检查及组织病理学检查。体格检查甲状腺肿大呈弥漫性、分叶状或结节性肿大，质地大多韧硬，与周围组织无粘连。实验室检查甲状腺自身抗体、血清游离三碘甲腺原氨酸、血清游离甲状腺素和促甲状腺激素是评价甲状腺功能以及用于疾病分期的主要手段。甲状腺过氧化物酶抗体和抗甲状腺球蛋白抗体是最具有诊断意义的指标，尤其在出现甲减以前，抗体阳性是诊断本病的唯一依据。影像学检查B超表现：回声不均，斑片型，弥漫减低型，结节型。随病情发展可见网格状高回声为桥本甲状腺炎所特有的超声显像，有鉴别诊断价值。CT对辨别甲状腺形态、占位性病变或转移病灶具有重要价值。组织病理学检查在临床症状不明显，实验室检查及影像学检查无法确诊时，甲状腺细针穿刺细胞学检查可见大量的淋巴细胞浸润有其重要意义。