医生诊断婴儿便秘一般根据临床表现即可诊断。婴儿超过48小时未排便就可能存在便秘。通过观察和直肠指检，可以判断婴儿是否有肛瘘、肛周脓肿、脱肛等并发症。腹部X线检查可以检查是否有先天肠道畸形，比如肠套叠、肠扭转、肠狭窄等，明确病因。如果有这些情况可以选择进行手术来改善症状。