本病的治疗原则是：积极治疗原发疾病，及时补充叶酸或维生素B12。治疗原发疾病有原发病（如胃肠道疾病、自身免疫病等）的巨幼细胞性贫血，应积极治疗原发病。补充叶酸或维生素B12补充叶酸叶酸缺乏者，口服叶酸治疗，用至贫血表现完全消失。如同时有维生素B12缺乏，则需同时注射维生素B12，否则可加重神经系统损伤。补充维生素B12维生素B12缺乏者，可肌肉注射维生素B12治疗。如果维生素B12吸收正常，可口服维生素B12治疗，直至血象恢复正常。如果有神经系统表现，治疗需要维持半年到1年。恶性贫血患者，需要终身维持治疗。