根据发热、脾大、血细胞减少、高三酰甘油血症和(或)低蛋白血症、骨髓、脾脏或淋巴结中发现吞噬血细胞作用，并能排除引起HPS临床现象的疾病，可确立诊断。满足以下主要诊断标准或次要诊断标准任何一项，即可诊断为噬血细胞综合征。主要诊断标准分子生物学检查符合噬血细胞综合征（例如存在PRF或SAP基因突变）；次要诊断标准（满足以下８项诊断标准中的５项）发热持续时间≥７天，最高体温≥３８.５℃；脾大，肋下≥３ｃｍ；外周血两系或三系血细胞减少，其中血红蛋白＜９０ｇ／Ｌ（年龄＜４周的婴儿，血红蛋白＜１００ｇ／Ｌ），血小板＜１００×10⁹／Ｌ，中性粒细胞＜１．０ ×10⁹／Ｌ；高甘油三脂血症和（或）低纤维蛋白原血症，空腹甘油三脂≥３．０ｍｍｏｌ／Ｌ，纤维蛋白原≤１．５ｇ／Ｌ；血清铁蛋白含量 ≥５００ ｎｇ／ｍＬ；ｓＣＤ２５（ｓＩＬ－２Ｒ）≥２４００Ｕ／ｍｌ；ＮＫ 细胞活性减低或缺如；在骨髓、脾或淋巴结内发现噬血细胞增多。