肺不张的治疗主要是去因疗法、对症治疗及手术治疗。通过治疗，可以改善症状，防止肺功能进一步损害和预防并发症。去因疗法有特殊病因者医生会针对病因进行治疗，如利用支气管镜取出异物，应用抗生素及抗结核药物治疗等。患儿分泌物堵塞支气管造成的肺不张，一般采用雾化吸入，变动患儿的体位，或利用拍背方法，使分泌物容易向外排出，必要时支气管镜下吸痰。痰量过多而不易咳出者，可行吸痰包括支气管镜下吸痰，必要时可能需要做气管切开。对症治疗给予支气管扩张药、化痰平喘药。呼吸困难时可能需要吸氧，必要时医生会应用呼吸机辅助治疗。手术治疗反复严重呼吸道感染或反复咯血者应考虑对不张的肺叶或肺段作手术切除。肿瘤引起的肺不张可能需要手术，同时进行放射治疗或化学治疗。