功能性胃肠病由生物、心理、社会因素共同作用引起，精神心理因素是诱发胃肠功能紊乱的主要原因。精神心理因素精神紧张、焦虑、抑郁、压力过大，遭遇负性事件如失业、亲人去世、性虐待、婚姻破裂等，上述因素都可以造成胃肠道功能紊乱。其他因素有急性胃肠道感染病史者，胃肠道功能紊乱患病风险明显升高。肠易激综合征属于肠道功能紊乱，肠易激综合征有家族遗传倾向。